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文献分享# 新冠病毒的两种亚型

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3月3号,中国科学院主办的《国家科学评论》(National Science Review)发表题为《关于SARS-CoV-2的起源和持续进化》的论文。文中对103个SARS-CoV-2基因组进行的群体遗传学分析表明,这些病毒演变成两种主要类型(命名为L和S);L型(〜70%)更为普遍,但S型(〜30%)更古老。
 
文中提出尽管L型是从古代S型新进化而来的,但它在人类群体中的传播或复制速度更快,L可能比S类型更具攻击性和侵略性。但目前尚不清楚在SARS-CoV-2的发展过程中L型是如何从S型特别进化的。
 
根据研究分析的103个新冠病毒基因组数据表明,这些病毒株一共存在149个突变位点,且多数突变在近期发生。具体而言,两个亚型的区别在于病毒RNA基因组的第28144位点,L型是T碱基(对应亮氨酸,Leu),S型是C碱基(对应丝氨酸,Ser)。通过与其他冠状病毒比较,作者发现S型新冠病毒与蝙蝠来源的冠状病毒在进化树上更接近,从而得出S型相对更古老的结论。

 
 
图注:103个SARS-CoV-2基因组的无根系统发育树


 
 
图注:SARS-CoV-2病毒的单倍型分析

作者在文章中表示,后续工作需要扩大样本量,以验证这些结论或推测。
 
 
 
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