乙酰化
Q1:乙酰化是如何定义的?
乙酰化是一种重要的蛋白质翻译后修饰方式,它能通过多种途径影响蛋白质的功能特性,比如调整蛋白质的稳定性、酶活性、亚细胞定位,以及与其它翻译后修饰的相互作用。此外,乙酰化还能调控蛋白质和DNA的相互作用,进而参与染色质结构的重塑、转录因子的激活以及代谢过程的调控等,几乎涵盖了所有关键的生物学过程。
Q2:当前乙酰化机制研究的进展概况
乙酰化作为国家自然科学基金(国自然)机制设计中的一个热门方向,在2020年就有超过200项中标基金以其为核心。它常见的作用机制多样,例如:主角基因能通过调控组蛋白的乙酰化修饰来影响疾病;主角基因自身的乙酰化修饰也能对疾病产生影响;主角基因的上游调节因子若发生乙酰化修饰,会直接影响疾病进程;还有主角基因通过招募A基因来调节B基因的去乙酰化修饰,从而间接影响疾病。
从乙酰化的角度出发,可以深入探究多种疾病的发生发展机制。这些疾病类型广泛,包括但不限于肿瘤类疾病(如肝癌、前列腺癌、口腔鳞癌、乳腺癌、神经母细胞瘤、肾透明细胞癌、三阴性乳腺癌的放疗抵抗、膀胱癌的化疗耐药等)、心血管类疾病(如心脏损伤、巨噬细胞泡沫化调控的动脉粥样硬化、压力过载性心肌重构等)、代谢类疾病(如糖尿病的肾小管上皮细胞线粒体生物合成异常、丙戊酸导致的肝毒性等)、炎症类疾病(如变应性鼻炎的发病机制)以及脑部疾病(如脑卒中后的神经发生、阿尔茨海默病中小胶质细胞的M2/M1极化表型平衡等)。
Q3:乙酰化研究热点在生物信息学分析中的应用策略
思路一:乙酰化相关单基因思路
当把研究焦点放在乙酰化相关基因上,并试图证明该基因是肿瘤的关键驱动因素及预后标志物时,为了增强研究的深度和说服力,多数审稿人会建议增加基因功能实验来验证所选主角基因的实际研究价值。这意味着,除了进行生物信息学分析外,还需要通过实验方法来确认该基因在肿瘤发展中的作用,以及它作为预后标志物的潜力。这样的实验证据能够进一步提升文章的科学性和实用性。
思路二:乙酰化相关signature
该文采用了一种典型的signature构建策略:首先,利用无监督聚类技术来区分不同的组蛋白乙酰化特征模式;接着,基于这些模式间差异表达的基因,构建了一个名为HAscore的模型。此模型旨在量化组蛋白乙酰化的特定模式,并进一步探索HAscore与临床特征以及疾病治疗反应之间的潜在联系。
思路三:蛋白质组学联合乙酰化组学
该文综合运用蛋白质组和乙酰化修饰组技术,深入分析了人类肝癌组织、癌旁组织及正常肝组织中乙酰化修饰的变化情况,对乙酰化在肝癌发病机理中的角色进行了系统探讨。研究结果显示,组蛋白乙酰化修饰能够作为预测乙型肝炎相关性肝癌患者预后的有效指标。
除了上述已发表的研究成果所展现的分析路径,乙酰化与生物信息学相结合的研究领域仍然充满潜力。例如,可以探索乙酰化相关的疾病分型策略,这是一种深入理解疾病异质性的经典方法。此外,从泛癌的角度去研究乙酰化基因的功能也是一个值得关注的方向,这有助于我们更全面地理解乙酰化在不同类型癌症中的作用机制。另外,还可以尝试构建乙酰化相关的疾病诊断模型,以预测个体是否会发生特定疾病或评估非肿瘤疾病的状态,这也是一个经典且重要的研究思路。
名称 | 货号 | 规格 |
乙酰化-L-丙氨酸-NHMe | abs42144485-1g | 1g |
乙酰化-D-丙氨酸甲酯 | abs45125507-1g | 1g |
乙酰化-L-丙氨酸-AMC | abs45133113-50mg | 50mg |
乙酰化氟替卡松 | abs44117677-10mg | 10mg |