一、实验思路框架
样本来源类型 | 成年BALB/c小鼠肺组织和小肠固有层 |
检测指标 | 22色 |
流式仪器型号 | Cytek® Aurora |
靶标细胞亚群 | ILCP、ILC1、ILC2、NCR⁺ILC3、NCR⁻ILC3、CCR6⁺LTI-like ILC3、NK细胞(trNK、cNK) |
二、配色方案
指标 | 克隆号 | 荧光素 | 激光通道(推断) | Purpose |
CD45 | 30-F11 | BUV395 | 355nm UV | 泛白细胞标记 |
IL-7Rα | SB/199 | PE-Cy5 | 488nm Blue | 泛ILC标记 |
PLZF | MAGS21F7 | PE | 561nm Yellow-Green | ILCP标记 |
IL-18Rα | P3TUNVA | PerCP-eFluor 710 | 488nm Blue | ILCP和ILC1标记 |
T-bet | 4810 | BV421 | 405nm Violet | ILC1和ILC3亚群标记 |
NKp46 | 29A1.4 | PE/Dazzle 594 | 561nm Yellow-Green | ILC1、ILC3亚群和NK细胞标记 |
CD49a | Ha31/8 | BUV496 | 355nm UV | ILC1亚群和trNK细胞标记 |
TRAIL | N2B2 | PE-Cy7 | 561nm Yellow-Green | ILC1亚群标记 |
IFN-γ | XMG1.2 | BUV737 | 355nm UV | ILC1和NK细胞功能标记 |
GATA-3 | L50-823 | BB700 | 488nm Blue | ILC2标记 |
KLRG1 | 2F1 | BV480 | 405nm Violet | ILC2标记 |
ST2 | U29-93 | R718 | 637nm Red | ILC2标记 |
IL-5 | TRFK5 | APC | 637nm Red | ILC2功能标记 |
IL-13 | eBio13A | eFluor 450 | 405nm Violet | ILC2功能标记 |
RORγt | Q31-378 | BV786 | 405nm Violet | ILC3标记 |
CCR6 | 140706 | BV711 | 405nm Violet | ILC3亚群分类标记 |
IL-17A | TC11-18H10.1 | BV650 | 405nm Violet | ILC3功能标记 |
IL-22 | Poly5164 | Alexa Fluor 647 | 637nm Red | ILC3功能标记 |
CD49b | DX5 | eFluor 506 | 488nm Blue | NK细胞标记 |
Ki-67 | SolA15 | Alexa Fluor 532 | 561nm Yellow-Green | 增殖细胞标记 |
Lineage Mix | 多种 | FITC(共13种) | 488nm Blue | 排除T、B、髓系、红细胞等非ILC细胞 |
LIVE/DEAD | - | Blue(荧光染料) | 405nm Violet | 死活细胞区分 |
三、圈门逻辑
1、排除碎片、双联体、死细胞、红细胞:
使用SSC-A vs SSC-B(405nm vs 488nm)去除红细胞污染;
使用LIVE/DEAD™ Blue排除死细胞;
选择CD45⁺活细胞。
2、总ILC圈门:
从CD45⁺细胞中选出IL-7Rα⁺且Lineage⁻(CD3, CD4, CD5, CD11b, CD11c, CD19, B220, F4/80, FccR1, Gr1, TCRβ, TCRγδ, Ter119)的细胞
3、ILCP圈门:
在ILC中选出PLZF⁺IL-18Rα⁺的细胞。
4、成熟ILC亚群圈门:
ILC1:T-bet⁺ RORγt⁻ ST2⁻ CD49b⁻ IL-18Rα⁺ NKp46⁺ CD49a⁺/TRAIL⁺/⁻
ILC2:GATA-3⁺ T-bet⁻ RORγt⁻ KLRG1⁺/⁻ ST2⁺/⁻
ILC3:
NCR⁺ILC3:RORγt⁺ T-bet⁺/⁻ NKp46⁺ CCR6⁻
NCR⁻ILC3:RORγt⁺ T-bet⁺/⁻ NKp46⁻ CCR6⁻
CCR6⁺ LTI-like ILC3:RORγt⁺ T-bet⁻ NKp46⁻ CCR6⁺(部分CD4⁺)
5、NK细胞圈门:
从Lineage⁺中选出CD11b⁺ NKp46⁺ T-bet⁺的细胞,进一步分为:
trNK:CD49a⁺ CD49b⁻
cNK:CD49a⁻ CD49b⁺
6、功能分析:
使用PMA/Ionomycin/BFA + 细胞因子刺激(IL-12/IL-18、IL-33、IL-1β/IL-23)后,检测IFN-γ、IL-5、IL-13、IL-17A、IL-22和Ki-67表达。
四、流式结果图

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参考文章
Full Spectrum Flow Cytometry for High-Dimensional Immunophenotyping of Mouse Innate Lymphoid Cells