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5.2 mtDNA甲基化检测

5.1 mtDNA提取与突变检测 | 5.3 单细胞mtDNA测序(sc-mtDNA-seq)

研究思路:mtDNA编码13个ETC蛋白,突变导致线粒体病、衰老、癌症,表观修饰(甲基化、羟甲基化)调控mtDNA转录,单细胞水平解析mtDNA异质性。

实验步骤

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    实验流程

    1、mtDNA提取:同前,确保无核DNA污染。

    2、甲基化检测:

    a)亚硫酸氢盐测序(BSP):mtDNA亚硫酸氢盐转化,PCR扩增目标区域(如D-loop区),测序分析CpG位点甲基化水平。

    b)甲基化芯片:Illumina Infinium MethylationEPIC芯片,检测mtDNA甲基化位点。