5.3 单细胞mtDNA测序(sc-mtDNA-seq)
5.2 mtDNA甲基化检测 | 6.1 线粒体-内质网接触位点(MAMs)
研究思路:mtDNA编码13个ETC蛋白,突变导致线粒体病、衰老、癌症,表观修饰(甲基化、羟甲基化)调控mtDNA转录,单细胞水平解析mtDNA异质性。
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实验流程
1、单细胞分离:流式分选/显微操作分离单个细胞,裂解后提取mtDNA。
2、全基因组扩增(WGA):MDA扩增mtDNA,NGS测序,分析单细胞mtDNA异质性、克隆演化。
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所需试剂、耗材、仪器(扩充)
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类别
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名称
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货号
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用途
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试剂
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mtDNA提取试剂盒
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abs50137 |
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蛋白酶K
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abs9118 |
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酚-氯仿
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Sigma P2069
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亚硫酸氢盐转化试剂盒
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Zymo EZ DNA Methylation-Gold
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WGA试剂盒
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Qiagen REPLI-g Single Cell
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耗材
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200uL PCR 8连管
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abs7094
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测序文库制备试剂盒
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Illumina
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仪器
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PCR仪
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Bio-Rad
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