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5.3 单细胞mtDNA测序(sc-mtDNA-seq)

5.2 mtDNA甲基化检测 | 6.1 线粒体-内质网接触位点(MAMs)

研究思路:mtDNA编码13个ETC蛋白,突变导致线粒体病、衰老、癌症,表观修饰(甲基化、羟甲基化)调控mtDNA转录,单细胞水平解析mtDNA异质性。

实验步骤

  • 1
  • 2
  • 1

    实验流程

    1、单细胞分离:流式分选/显微操作分离单个细胞,裂解后提取mtDNA。

    2、全基因组扩增(WGA):MDA扩增mtDNA,NGS测序,分析单细胞mtDNA异质性、克隆演化。

  • 2

    所需试剂、耗材、仪器(扩充)

    类别

    名称

    货号

    用途

    试剂

    mtDNA提取试剂盒

    abs50137

    蛋白酶K

    abs9118

    酚-氯仿

    Sigma P2069

    亚硫酸氢盐转化试剂盒

    Zymo EZ DNA Methylation-Gold

    WGA试剂盒

    Qiagen REPLI-g Single Cell

    耗材

    200uL PCR 8连管

    abs7094

    测序文库制备试剂盒

    Illumina

    仪器

    PCR仪

    Bio-Rad