• 学术首页
  • 解决方案
  • 文章专题

搜索

商城

用户

  • 学术首页
  • 解决方案
  • 文章专题

返回

目录

用户

购物车

6.2.1 rRNA 去除

| 6.2.2 mRNA建库

如下操作步骤以产品货号333180的步骤为例,产品列表详见右下方推荐产品

实验步骤

  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 1

    开始前的要点

    使用此方案需要 QIAseq Stranded mRNA Select Kit(货号 180773180775),可在QIAGEN官网下载查看。


    重要提示:去除珠蛋白时,需要执行 2 个额外的 CleanStart Library Amplification 循环


    请参阅 QIAseq Stranded mRNA Library Kit 手册,网址为www.qiagen.com/HB-2464

  • 2

    mRNA 富集

    QIAseq Stranded mRNA Library Kit Handbook 中,使用推荐的总 RNA 输入量(100 ng - 1 µg)执行“协议:mRNA 富集”。最终在 27 µl 中洗脱富集的 mRNA

  • 3

    准备 RNA 片段化和 QIAseq FastSelect -Globin 去除所需的试剂

    2a.在室温下解冻来自 QIAseq Stranded 试剂盒的 5x RT 缓冲液、无核酸酶水和来自 QIAseq FastSelect 试剂盒的 QIAseq FastSelect −Globin 管

    2b.通过涡旋混合,然后短暂离心。

  • 4

    短暂离心

    在冰上,根据表 5。短暂离心,上下吹打混合 10 次,然后再次短暂离心。

    注意:如果设置多个反应,请准备比反应总数所需量大 10% Master Mix

    表 5. 片段化/RNA 去除反应的设置

    零件 体积/反应
    mRNA 富集反应(已在试管中)  27µl
    RT 缓冲液,5x* 8 µl
    QIAseq FastSelect −珠蛋白 1 µl
    ERCC控制† 可选 
    无核酸酶水 1 µl
    总容积 37µl

    *来自 QIAseq Stranded Total RNA Lib Kit
    ERCC Control RNA 可根据制造商指定的浓度添加。如果添加,用 ERCC 替换无核酸酶水 (1 µl)。

  • 5

    如中所述孵育表 6,根据您输入的 RNA 质量和所需的插入片段大小

    表 6. 组合的 QIAseq 链式碎片和 FastSelect 杂交协议

    输入 RNA 质量 插入大小 ~150−250 bp 插入大小 ~350 bp
    高品质 (RIN >9) 1* 95°C 15 分钟 95°C 下 3 分钟
    中等质量(RIN 5-6) 1* 95°C 10 分钟 95°C 下 3 分钟
    FFPE 或降解样品 (RIN <3) 1* 无碎片† 无碎片†
    无论输入 RNA 质量如何,都会执行步骤 2-9。无论 RNA 是高质量、中等质量、FFPE 还是降解,都需要执行它们。 2 75°C 下 2 分钟 75°C 下 2 分钟
    3 70°C 下 2 分钟 70°C 下 2 分钟
    4 65°C 下 2 分钟 65°C 下 2 分钟
    5 60°C 下 2 分钟 60°C 下 2 分钟
    6 55°C 下 2 分钟 55°C 下 2 分钟
    7 37°C 下 2 分钟 37°C 下 2 分钟
    8 2 分钟,25°C 2 分钟,25°C
    9 保持在 4°C 保持在 4°C

    *根据输入的 RNA 质量和所需的插入大小,为第 1 步选择一个选项。
    也适用于大小在 80-500 bp 之间的外泌体 RNA 或其他来源的 RNA


    重要提示:
    无论步骤 1 中选择的时间和温度如何,都必须执行步骤 2-9

  • 6

    请参阅 QIAseq Stranded mRNA Library Kit 手册并立即进入“协议:第一链合成”

       

  • 7

    按照 QIAseq Stranded mRNA Library Kit 手册执行所有剩余的文库构建步骤

    重要

    △点击放大图片

    去除珠蛋白时,需要执行 2 个额外的 CleanStart 文库扩增循环。

    以上商品加入询价单,并继续购买其他商品