柱效表明层析柱的性能。层析柱的柱效应该固定间隔时间进行检测。如果层析柱出现性能下降等情况，为了验证层析柱的性能，应及时进行柱效测定。此外，在装柱之后也要进行层析柱的柱效测定。
方法
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查找参数
柱效测定可以使用丙酮或者氯化钠方法，具体方法和参数在说明书中查阅，也可参考以下表格。
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以 superdex 6 increase10/300层析柱为例，柱效测定的样品采用100微升的2%丙酮，流动的缓冲液用超纯水，室温下流速可以设定为1ml/min，监测UV280吸收峰值。
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设置报警压
报警压的参数信息可以参考说明书，纯化手册，或者点击Unicorn软件中的column handling选项查看。分别设置最大柱前压和最大delta压。
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连接层析柱
为系统设定一个低流速，按照液滴对液滴的方式连接层析柱。
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设定柱效测定方法
打开UNICORN软件，选择Method Editor界面，编辑方法，建立新方法。点击预设定方法，选择performance test柱效测定，点击确认。在方法设定中选择层析模式和层析柱类型，选择柱位，调整合适的流速，确认液体流路，点击平衡方法检查流速，确认流路和平衡的体积数。点击柱效测试方法，检查流速，确认上样方式以及上样体积，确认洗脱体积，保存该方法。
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上样
将上样环连接仪器。取出一支注射器，用超纯水清洗上样环。然后打入足量的2%丙酮。
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运行柱效测定程序
打开UNICORN软件，点击进入system control界面，打开保存的方法运行。
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柱效结果分析
打开UNICORN软件，点击进入evaluation界面，打开results结果导览界面，双击检测结果，选择需要进行积分的曲线，单击曲线名称右侧fx即可。柱效相关参数需在对曲线积分后，在积分表格右上角设置中勾选相关参数显示，例如不对称性，HETP塔板高度、plates/meter每米塔板数。在选择参数显示后，需要在右下角输入该层析柱的柱高信息，否则无法显示对应塔板信息。