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1.1.1 查找目的基因序列

| 1.1.2 选择合适的表达载体

由于引物是根据目的基因序列来设计的,所以查找到目的基因序列是设计引物的第一步。查找目的基因序列可以在多个网站上查到,也可以在文献中查找。
这里介绍的是比较常用的NCBI网站查找基因序列的方法。NCBI是美国国家生物技术信息中心,网站上具有多个生物数据库,是生物学研究常用的网站。
以下对步骤进行梳理,详细操作请查看视频。

实验步骤

  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 1

    输入基因/蛋白名称

    打开NCBI网站(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/),在下拉框选择Gene,输入目的蛋白名称;(这里以p65为例)

     

    △点击放大图片

  • 2

    选择对应物种

    找到对应物种,也可以选择右侧框中的物种查找;

     

    △点击放大图片

  • 3

    点击mRNA and Proteins

    页面往下拉,找到mRNA and Protein(s),选择正确的isoformNMxxx表示mRNA序列,NPxxx表示蛋白质序列;

     

    △点击放大图片

  • 4

    查找CDS序列

    新页面往下拉,点击CDS,点击右侧FASTA,即可得到目的基因的mRNA序列,复制粘贴到新的文本,以备使用。

     

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