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His标签：His标签由于其分子量小且价格便宜，是最常用的标签之一。His标签通常由6-10个氨基酸组成，利用多聚组氨酸对二价金属离子具有高选择性亲和力的特点，我们可以把金属离子（常用为Ni离子）通过NTA或者IDA连接在琼脂糖树脂上进行His标签的纯化。由于His标签较小，所以通常纯化后不用切除标签，并且可以和其他标签联用构成双标签。如果His标签纯化有杂带，可以考虑使用多个咪唑浓度梯度洗脱或者用仪器进行咪唑线性洗脱。

GST标签：GST标签也是常用的标签。GST标签全称为Glutathione S-transferase（谷胱甘肽巯基转移酶），可以特异性的结合其酶活底物谷胱甘肽。GST填料上固定有谷胱甘肽配基，可用于特异性纯化带有GST标签的蛋白。

GST标签可以提高蛋白表达的可溶性和表达量，并且也具有较高的纯度。一般用GST标签纯化后的条带都比较单一，可以一步得到非常高的纯度。

由于GST标签比较大，所以在纯化后通常需要将纯化后的蛋白上的GST标签切除。可以选择柱上酶切或者柱下酶切的方法。在构建质粒时，需要考虑到在GST标签和目的蛋白中间加上特定的蛋白酶酶切位点。

如果想要得到非常高的纯度，或者蛋白有相近的难以去除的杂带，可以选择Strep标签。Strep标签为一段长度仅为8个氨基酸的短肽，可以结合链霉亲和素。而现在常用的Strep填料的配基为链霉亲和素改造之后的Strep-Tactin配基，大大增加了和Strep标签的结合能力。

此外，Twin-Strep标签也受到很多客户的青睐。Twin-Strep标签是由两段Strep肽段和之间的连接序列构成的，和普通的Strep标签相比具有纯度更高，可耐受变性剂等特点。

MBP标签全称为maltose Binding Protein（麦芽糖结合蛋白），分子量较大（42KD）。MBP填料上的糊精配基可以特异性的结合MBP标签蛋白。MBP标签具有促进重组蛋白溶解的功能，在过表达目的蛋白的过程中也有助于减少包涵体。