非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(Native-PAGE)或称为活性电泳是在不加入SDS和巯基乙醇等变性剂的条件下，对保持活性的蛋白质进行聚丙烯酰胺凝胶电泳，常用于酶的鉴定、同工酶分析和提纯。

未加SDS的天然聚丙烯酰胺凝胶电泳可以使生物大分子在电泳过程中保持其天然的形状和电荷，它们的分离是依据其电泳迁移率的不同和凝胶的分子筛作用，因而可以得到较高的分辨率，尤其是在电泳分离后仍能保持蛋白质和酶等生物大分子的生物活性，对大分子的鉴定有重要意义。 

非变性聚丙烯酰胺凝胶和变性SDS-PAGE电泳在操作上基本上是相同的，只是非变性聚丙烯酰胺凝胶的配制和电泳缓冲液中不能含有变性剂如SDS等。

一般蛋白进行非变性凝胶电泳要分清是碱性蛋白还是酸性蛋白。

分离碱性蛋白时，要用低PH凝胶系统，分离酸性蛋白时，要用高PH凝胶系统。

酸性蛋白通常在非变性凝胶电泳中采用的PH是8.8的缓冲系统，蛋白会带负电荷，向阳极移动;

而碱性蛋白电泳通常是在微酸性环境下进行，蛋白带正电荷，这时候需要将阴极和阳极倒置才可以电泳分离碱性蛋白。