限制性内切酶
限制性内切酶,全称限制性核酸内切酶,是一种专门作用于双链DNA的酶类,其切割机制涉及断裂DNA链中糖基与磷酸基团之间的连接键,从而在两条DNA链上分别形成一个切口,此过程不改变核苷酸的组成及其碱基序列。限制性内切酶在分子生物学及遗传工程领域内具有广泛的应用价值。
中文名 | 限制性核酸内切酶 | 作 用 | 切割DNA |
所属学科 | 基因工程 | 别 名 | 限制酶 限制性内切酶 |
定义
一类能够特异性地识别DNA中的特定序列,并在该识别位点或其邻近区域对双链DNA进行切割的内切酶。
由来
限制性内切酶,通常以其来源微生物属名的首字母和种名的前两个字母命名,第四个字母则代表具体的菌株(或品系)。例如,源自Bacillus amyloliquefaciens H的限制性内切酶被命名为BamH。对于在同一菌株中发现的具有不同碱基序列识别特异性的多种酶,可通过添加罗马数字进行区分,如HindⅡ、HindⅢ,HpaI、HpaⅡ,以及MboI、MboⅡ等。
限制性内切酶,作为一种在特定核苷酸序列处对双链DNA进行水解的内切酶,根据其功能特性可分为两类:Ⅰ型限制性内切酶既能催化宿主DNA的甲基化,也能催化非甲基化DNA的水解;而Ⅱ型限制性内切酶则仅催化非甲基化DNA的水解。该酶在学术上亦被称为Endodeoxyribonuclease,简称限制酶。
在酶反应方面,限制性内切酶能够在DNA分子的限定数量专一部位上进行切割,具有识别并降解外源DNA的能力。其单位定义是指在指定的pH值与37℃条件下,0.05mL反应混合物中1小时内能够消化1μg λDNA的酶量。关于性状与制品,合格的限制性内切酶制品应不含非专一性的核酸水解酶,这一特性可通过将10单位内切酶与1μg λDNA在37℃下保温16小时后,观察凝胶电泳图谱的稳定性来验证。这类酶主要分离自原核生物,迄今为止,已从近300种不同的微生物中分离出约4000种限制酶。
分布区域
限制性核酸内切酶在自然界中的分布极为广泛,几乎在所有细菌的属和种中都能至少发现一种此类酶。在某些细菌属中,限制性内切酶的种类甚至多达几十种,例如在嗜血杆菌属(Haemophilus)中,目前已发现的限制性内切酶就有22种之多。值得注意的是,不同菌株中限制性内切酶的含量存在显著差异,部分菌株中的酶含量极低,难以进行有效的分离和定性分析;而另一些菌株则富含此类酶,如大肠杆菌(Escherichia coli)的pMB4菌株(产EcoRI酶)和埃及嗜血杆菌(Haemophilus aegyptius,产Hal III酶)即为高产酶菌株。据文献报道,从仅10克的埃及嗜血杆菌细胞中,就能分离提纯出足够消化10克λ噬菌体DNA的酶量。迄今为止,细菌仍然是限制性内切酶,特别是具有高特异性的Ⅰ类限制性内切酶的主要来源。
分类性质
依据酶的功能特性、分子量大小以及反应所需的辅助因子,限制性内切酶可被划分为两大类:I类酶与Ⅱ类酶。早期从大肠杆菌中发现的EcoK和EcoB即属于I类酶。这类酶的分子量较大,在催化反应过程中,除了需要Mg²⁺外,还需S-腺苷-L-甲硫氨酸(SAM)和ATP作为辅助因子。值得注意的是,I类酶在DNA分子上并不产生特异性的酶解片段,这是其与Ⅱ类酶之间最为显著的区别,也因此限制了I类酶在DNA分析中的应用价值。
相较于I类酶,Ⅱ类酶如EcoR I、BamH I、Hind II、Hind III等,则具有更为广泛的应用前景。这类酶的分子量小于105道尔顿,反应过程中仅需Mg²⁺作为辅助因子。更重要的是,Ⅱ类酶能够在所识别的特定碱基序列上产生特异性的切割位点。因此,当DNA分子经过Ⅱ类酶处理后,会产生特异性的酶解片段,这些片段可通过凝胶电泳法进行分离和鉴别。
限制性内切酶主要识别DNA序列中的回文序列。部分酶的切割位点位于回文序列的一侧(如EcoR I、BamH I、Hind等),从而形成粘性末端;而另一些Ⅱ类酶(如Alu I、BsuR I、Bal I、Hal III、HPa I、Sma I等)的切割位点则位于回文序列的中间,形成平整末端。
在已发现的限制性内切酶中,已有近百种酶的识别序列被测定。值得注意的是,有些来源不同的酶具有相同的碱基识别序列,这类酶被称为“异源同功酶”(isochizomer,或同切限制内切酶、同裂酶)。然而,尽管这些酶具有相同的识别序列,但它们的切割位点可能并不完全一致。例如,Xma I和Sma I都识别六核苷酸序列CCCGGG,但Xma I的切割位点在cCCGGG处,形成带有CCGG粘性末端的DNA片段,而Sma I的切割位点则在CCCG↓GGG处,不形成粘性末端。当然,也存在识别序列和切割位点都相同的酶,如Hap II、Hpa II、Mno I都在识别序列CCGG内有一相同的切割位点,Hal III和BsuR I同样在识别序列GGCC内有一相同的切割位点。
E |
Escherichia |
(属) |
co |
coli |
(种) |
R |
RY13 |
(品系) |
I |
首先发现 |
在此类细菌中发现的顺序 |
类型
第一型限制性内切酶(Type I restriction endonucleases)兼具修饰(modification)与识别切割(restriction)的双重功能。它们能够识别DNA分子上的特定碱基序列,并且其切割位点往往距离识别位点数千个碱基之远。这类酶的典型代表包括EcoB和EcoK。
第二型限制性内切酶(Type II restriction endonucleases)则专注于识别切割的功能,其修饰作用通常由其他酶类承担。它们所识别的序列多为较短的回文序列(palindrome sequences),并且所剪切的碱基序列通常与识别序列一致。在遗传工程领域,第二型限制性内切酶因其较高的实用性而备受青睐,典型的例子有EcoRI和HindIII。
第三型限制性内切酶(Type III restriction endonucleases)在功能上与第一型限制酶相似,同样具备修饰与识别切割的双重能力。然而,它们所识别的序列通常为较短的不对称序列,且切割位点与识别序列之间的距离约为24-26个碱基对。HinfIII是第三型限制性内切酶的一个典型代表。
名称 | 货号 | 规格 |
BsaⅠ 限制性内切酶 | UA070035-1KU | 1KU |
快速内切酶BstBI | abs60207-100T | 100T |
胃酶(1:15000) | abs9193-50g | 50g |
几丁质酶 | abs47047903-1g | 1g |